Již tři týdny v Mikrobiologickém ústavu AV ČR – Centru ALGATECH v Třeboni v Opatovickém mlýně probíhá každodenní testování vzorků z Nemocnice Jindřichův Hradec na přítomnost koronaviru metodou PCR. Koncem března, kdy propukla epidemie koronaviru a byl kritický nedostatek testovacích kapacit, nabídla akademická pracoviště své odborné znalosti a potřebné přístrojové vybavení. Tehdy se všechny vzorky z celého kraje vozily k analýze do Budějovic a doba zpracování byla velmi dlouhá. V Třeboni vznikla nabídka pomoci přetíženému zdravotnictví spontánně mezi vědeckými pracovníky, kteří se zabývají molekulární biologií. Kontaktovali jsme Nemocnici v Jindřichově Hradci, která naší nabídku uvítala, a od té doby úzce spolupracujeme. Nejprve jsme museli od Státního zdravotního ústavu získat potřebnou licenci, která zaručuje, že splňujeme všechny přísné bezpečnostní a laboratorní podmínky. Pro laboratorní analýzy jsme vyčlenili jednu speciálně vybavenou laboratoř a vyškolili týmy, které se při provádění analýz střídají. Krajský holding nemocnic nám zajistil dodávku ochranných prostředků pro práci s virem. Třicátého března jsme začali „naostro“ s analýzou prvních 63 vzorků od Nemocnice Jindřichův Hradec. Vzorky odebrané pacientům v odběrovém stanu nebo na odděleních nemocnice jsou k nám dopravovány několikrát denně sanitkou v kontejnerech s několika bezpečnostními obaly. Po příjezdu jsou vzorky přemístěny do izolačního boxu, kde jsou okamžitě inaktivovány a nadále již nejsou infekční. Toto probíhá v uzavřené místnosti, kam má přístup jen obsluha vybavená speciálními ochrannými prostředky. Pak jsou ze vzorku vyizolovány nukleové kyseliny. Z jejich složení poznáme, zda je pacient napaden virem Covid-19. Poslední část měření, která stanovuje přítomnost a množství viru, již může probíhat v běžné laboratoři.  Celý proces od přijetí vzorku až k hlášení výsledku nám zabere pět až šest hodin. Vše se dělá manuálně a na analýze se podílí tým šesti až deseti lidí ze všech čtyř našich laboratoří, včetně administrativní podpory. Abychom zabezpečili co nejrychlejší odeslání výsledků na hygienickou stanici, pracujeme na směny.  Jednou za měsíc, o víkendové směně, také zpracováváme vzorky z celého kraje.

K dnešnímu dni, tj. k 20. dubnu 2020 jsme provedli analýzy u více než 750 vzorků. Výsledky každý den veřejnosti hlásí Krajská hygienická stanice v Českých Budějovicích. Dosavadní údaje jsou ve shodě s údaji celorepublikových statistik s tím, že v posledním týdnu začalo pozitivních nálezů rapidně ubývat. Jindřichohradecko má patrně nejméně pozitivních případů na počet obyvatel. Jsme velice rádi, že provádění analýz probíhá v našem centru poměrně rychle a to i ve srovnání s ostatními laboratořemi v České republice. Testovaní tak znají výsledky zpravidla do druhého dne od data odběru. Během uplynulých týdnů proběhlo testování i v řadách našich zaměstnanců bez jakéhokoli pozitivního nálezu. Celý proces je velmi náročný, jak po organizační, časové i finanční stránce. Proto bychom chtěli touto cestou poděkovat za pomoc i spolupráci všem našim zaměstnancům, kolegům ze spolupracujících laboratoří Biologického centra AV ČR, Přírodovědecké fakulty JčU a Nemocnice v Českých Budějovicích, vedení Jihočeského kraje, zejména Dr. Z. Roithové za příkladnou koordinaci celého úsilí, Městu Třeboň za zprostředkování ubytovacích kapacit pro případné dobrovolníky našeho centra a Krajské hygienické stanici v Českých Budějovicích a Ministerstvu zdravotnictví ČR za materiálovou podporu.

Ondřej Prášil a Markéta Stefanová, MBÚ AV ČR - Centrum ALGATECH Třeboň, Opatovický mlýn
Foto: © Shutterstock