Ondřej se v doktorském studiu věnuje regulaci biosyntézy tetrapyrrolů u sinic, konkrétně u Synechocystis sp. PCC 6803. Tetrapyrroly jsou prekurzory chlorofylu a hemu, které jsou nepostradatelné (nejen) pro fotosyntézu. Aby se zabránilo fototoxickému poškození způsobenému volným chlorofylem, musí být syntéza chlorofylu přísně regulována. Znalost toho, jak sinice řídí biosyntézu tetrapyrrolů a koordinují ji s dalšími biosyntetickými dráhami (syntéza chlorofylu, biogeneze fotosystémů atd.), by mohlo poskytnout cenné informace pro biotechnologický výzkum. Ondřej se ve své práci zabývá především enzymem GluTR (Glutamyl-tRNA-reduktáza), který je prvním enzymem syntézy tetrapyrrolů a je pravděpodobně zásadně zodpovědný za regulaci této dráhy. Cílem disertační práce je najít jeho možné interaktory a odhalit jejich úlohu v kontrole aktivity tohoto enzymu.