Pavel Hronek

Pavel ukončil v roce 2023 bakalářské studium na Jihočeské univerzitě v Českých Budějovicích. Od téhož roku pracuje v Centru Algatech jako bioinformatik. Pod vedením Venduly Krynické se zaměřuje především na analýzu RNA-sekvenačních dat prostřednictvím R studia s cílem zjistit, jaké geny jsou up- a down-regulovány za různých podmínek. Tato analýza ukazuje, které geny jsou určitou změnou prostředí nejvíce ovlivněny a zda jsou součástí určitých genových klastrů se specifickou funkcí. Pavel také úzce spolupracuje s Tomaschem Jürgenem z Laboratoře anoxygenních fototrofů. Spolu s ním pracoval na vytvoření sítě genů a jejich klastrů na základě jejich interakčních úrovní pro několik organismů pomocí platformy Cytoscape, a v poslední době se zaměřuje na zpracování HiC dat pro Gemmatimonas a Dinoroseobacter shibae a jejich kontaktních map s cílem studia konformace chromozomů.

 

Korespondenční adresa

Mikrobilogický ústav AV ČR, v.v.i
Centrum ALGATECH

Novohradská 237 - Opatovický mlýn
379 01 Třeboň
Česká republika

Kontakty

Vedoucí centra

Prof. Ing. Roman Sobotka, Ph.D.
Tel:
E-mail:

Jsme ALGAGECH

  • O nás
  • Povinné dokumenty
  • Patenty
  • Projekty
  • Tiskové zprávny

Nepropásněte

  • Aktuality
  • Publikace
  • Vědecké simenáře
  • Pro veřejnost

aa

bb

cc

Akademie věd České republikyMikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.euOperační program
Výzkum a vývoj pro inovaceInterreg EULogo OP VK